Hola Fernando,
matemáticamente es correcto pero ya he tenido el problema de que algunos programas no hacen bien el redondeo, se quedan simplemente con los 2 primeros decimales. Con lo que tienes razón y si fueras a juicio seguro que ganas pero te toca pelearte o rehacer la factura. Le puedes añadir una línea con concepto "corrección pq la uni no sabe de matemáticas" :-D
De todas formas vaya cliente, que por un céntimo ponga problemas... Imagino que Hacienda no te dirá nada por un céntimo menos de IVA que se llevan.