生猛的计算机配置方案

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lzt

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Mar 9, 2014, 11:57:22 PM3/9/14
to xidian...@googlegroups.com
小时候,总希望自己有超级牛掰的计算机,长大了见过一些高手之后,变得务实,深刻的理解计算机够用即可的道理,于是经常性的关注于简单,廉价的设备,比如CuBox,百度影棒2,这些都是非常好用的廉价的设备。还有以前介绍过的平板还有其他的一些东西。

随着计算需求的增长,需要配置更加生猛的计算机。我有位师兄,他在做图像实验的时候,便出现了这样的问题。希望得到一个更加生猛的配置。

我想各种实验室都会有这样的需求。

我说说我见过的实验室的现状吧。做图像的实验室都会买图形工作站,这是个极其废品的东西,显卡好到爆,更加昂贵。并没有将资金最大化利用。

各位图像实验室所作的实验其实和显卡没有多少关系,只要是进行计算密集型数据流运算。简单的说就是算法比较耗时,数据基本上处理过就不用回来。还有以少部分数据密集型运算,就是计算量并不大,但是需要全部数据进行运算,比如字典学习,稀疏分解,各种分解。

所以这个那个显卡半毛钱关系都没有。

出于上面的动机,我开始调查了解更加生猛的计算机配置方案。


lzt

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Mar 10, 2014, 12:25:48 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com


不好意思,刚才有事情被打断了,我接着写。

原因二,就是我身边有些土豪,(身边真的什么人都有)总跟我炫耀自己配置的计算机多么生猛。于是激起了我的(兴趣)。

他们的配置方案无非是i7的cpu,万元左右的(入门级)显卡,现在有用两块6000多块显卡交火的趋势,插满内存,4块SSD,直接连接到主板上,超级大的电源,炫酷的水冷,液体还是带着那(恶心人的)蓝色,然后主板上还有(蛋疼)的LED(灯泡)。机箱很贵但是看不出什么好来。
他们管这些叫做MOD。

一台计算机配下来2万块都有了。

就为了玩游戏,把某些游戏的FPS多跑那么几帧。其实就是赤裸裸的炫富。

于是,我就研究了一套2万块的配置方案。(暂时没钱,所以没实现,\(^o^)/~)

我讲讲我的想法,各位也可以说说自己的想法。

首先,上图片。

大概就是这个意思,十片atom+生猛的交换机把他们连接起来。

这个能完成实验室的任务要求但是玩不了游戏。

2万块经费,十片首先要拿出1000块买交换机,拿出一百块做个机箱。然后把剩下的钱分十份。

也就是大概每一片有1800块的经费,足可以上一个非常生猛的节点了,如果用atom的话怎么着也就1000块左右。

每个节点500G硬盘,十个节点5T。如果是SSD可以少买些,比如32G就可以了。

每个节点4G内存,十个节点40G。

这里推荐用atom的原因是省电,被动散热。

这里有些关键的地方需要详细的说一下。

这个系统依靠网络,所以本地硬盘的读写速度不用太大,如果是千兆网络的话,100M/s读写速度就可以了,普通硬盘都能轻松实现,所以硬盘成本很低。因为分成十份,所以,每一份不用太大硬盘。

关键是网络,所以买交换机的时候不要省钱。

能让他们连接起来的是OPENMPI,把它打到内核里面,然后按照教程配置好,这样就能用了。

实际中我做了一个没有这么大规模的只是四个节点,用OPENMPI 跑BoW和后面的SVM,效果非常好,就是学习字典的时候进行稀疏分解的时候,需要把那个稀疏分解变成多线程的方法。这样字典学习就快了。SVM的并行化很轻松。

和我们实验室那台最生猛的图像工作站比了一下,全面碾压。这些东西的造价是那个工作站的一半的价格。

所以,我斗胆预测,未来的计算机,单台计算机DIY兼容机已经到头了,这里会分成两个岔,一方面个人用,像平板这样ALL-in-ONE设备会逐步取代传统PC,在工作站这种计算需求更大的场景,可能这种微型的集群会逐步取代那些MOD设备。

进入新的时代,可能发烧友们玩的东西也该来场更新换代了吧。











Wisatbff Li

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Mar 10, 2014, 12:36:32 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
看起来好像云计算。。(不懂

在 14/3/10,lzt<lvzon...@gmail.com> 写道:
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> 不好意思,刚才有事情被打断了,我接着写。
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> 原因二,就是我身边有些土豪,(身边真的什么人都有)总跟我炫耀自己配置的计算机多么生猛。于是激起了我的(兴趣)。
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> 他们的配置方案无非是i7的cpu,万元左右的(入门级)显卡,现在有用两块6000多块显卡交火的趋势,插满内存,4块SSD,直接连接到主板上,超级大的电源,炫酷的水冷,液体还是带着那(恶心人的)蓝色,然后主板上还有(蛋疼)的LED(灯泡)。机箱很贵但是看不出什么好来。
> 他们管这些叫做MOD。
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> 一台计算机配下来2万块都有了。
>
> 就为了玩游戏,把某些游戏的FPS多跑那么几帧。其实就是赤裸裸的炫富。
>
> 于是,我就研究了一套2万块的配置方案。(暂时没钱,所以没实现,\(^o^)/~)
>
> 我讲讲我的想法,各位也可以说说自己的想法。
>
> 首先,上图片。
>
> <https://lh4.googleusercontent.com/-v3WdoB1EUVA/Ux06WjXcOII/AAAAAAAAAlw/yBaaTbuxRvU/s1600/2013-05-02.jpeg>
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> 大概就是这个意思,十片atom+生猛的交换机把他们连接起来。
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> 这个能完成实验室的任务要求但是玩不了游戏。
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> 2万块经费,十片首先要拿出1000块买交换机,拿出一百块做个机箱。然后把剩下的钱分十份。
>
> 也就是大概每一片有1800块的经费,足可以上一个非常生猛的节点了,如果用atom的话怎么着也就1000块左右。
>
> 每个节点500G硬盘,十个节点5T。如果是SSD可以少买些,比如32G就可以了。
>
> 每个节点4G内存,十个节点40G。
>
> 这里推荐用atom的原因是省电,被动散热。
>
> 这里有些关键的地方需要详细的说一下。
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> 这个系统依靠网络,所以本地硬盘的读写速度不用太大,如果是千兆网络的话,100M/s读写速度就可以了,普通硬盘都能轻松实现,所以硬盘成本很低。因为分成十份,所以,每一份不用太大硬盘。
>
> 关键是网络,所以买交换机的时候不要省钱。
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> 能让他们连接起来的是OPENMPI,把它打到内核里面,然后按照教程配置好,这样就能用了。
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> 实际中我做了一个没有这么大规模的只是四个节点,用OPENMPI
> 跑BoW和后面的SVM,效果非常好,就是学习字典的时候进行稀疏分解的时候,需要把那个稀疏分解变成多线程的方法。这样字典学习就快了。SVM的并行化很轻松。
>
> 和我们实验室那台最生猛的图像工作站比了一下,全面碾压。这些东西的造价是那个工作站的一半的价格。
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> 所以,我斗胆预测,未来的计算机,单台计算机DIY兼容机已经到头了,这里会分成两个岔,一方面个人用,像平板这样ALL-in-ONE设备会逐步取代传统PC,在工作站这种计算需求更大的场景,可能这种微型的集群会逐步取代那些MOD设备。
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> 进入新的时代,可能发烧友们玩的东西也该来场更新换代了吧。
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> <https://lh4.googleusercontent.com/-v3WdoB1EUVA/Ux06WjXcOII/AAAAAAAAAlw/yBaaTbuxRvU/s1600/2013-05-02.jpeg>
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lzt

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Mar 10, 2014, 12:41:02 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
可以理解成云计算的物理结构,或是具体实现?

云计算好像任务不能横跨多个物理cpu。所以,这个应该比云计算难度更大一些。

其实,我也不是很懂云计算,就是看过广告,还是视频广告那种。-_-|||

张鑫

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Mar 10, 2014, 1:28:03 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
单从实验室处理图像这个需求来看,可以把程序写成分布式的,

将处理流程划分成一些小的作业去分发执行,这样应该可以把机器资源有效利用起来

如果数据量比较大,需要大存储,而且还想用廉价设备

为了提高可用性,可以试试hadoop,仅仅用hdfs做存储就可以了


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Zhang Cheng

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Mar 10, 2014, 7:17:15 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
这东西很看用途的。游戏发烧友买的机器,要的不是性价比,而是“I am rich!”。非计算机专业的人根本无法去评估一台机器的性价比,至少没办法量化的去查找瓶颈在什么地方,硬盘io?网络ip?总线带宽?

随着并行计算的理论逐渐成熟,“怪物机器”的发展方向基本都是小单元、多单元化。例如见过一篇paper讲存储站,一台主机接40多个ssd,将总线带宽吃满,最大化了io吞吐量,最小化了功耗。

如果要理性的(要性价比尽可能高的)选购贵重的东西,最重要的还是要找到瓶颈。例如购买网卡,网卡有许多参数,例如pps(每秒转发packets的数量)、中断队列数等等(我现在也仅在这两个方面碰到过瓶颈,所以其他参数没有做过了解)。这些瓶颈跟应用场景有关,例如网卡的中断队列数,我们一般的服务器用普通网卡都没问题,但是网站前端的机器,qps很高,而且许多请求都很小,单位时间内网卡产生的中断非常多,普通的网卡只有一个中断队列,中断处理只能在一个CPU核上跑,结果200Mbps的带宽就把一个CPU核吃满了,这就成了瓶颈,虽然内核里也有RPS/RFS等补丁,但只能提高一倍左右的吞吐量,最终的解决方案还是更换支持多个队列的网卡。


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Cheng,
Best Regards

亦念

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Mar 10, 2014, 7:22:09 AM3/10/14
to xidian_linux
Tesla 在看着你……

------------------ 原始邮件 ------------------
发件人: "张鑫";<justz...@gmail.com>;
发送时间: 2014年3月10日(星期一) 中午1:28
主题: Re: [XiDianLinux] Re: 生猛的计算机配置方案

宋朝阳

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Mar 10, 2014, 10:08:47 AM3/10/14
to xidian_linux
既然谈到这个话题了,我把我们实验室面临的“困境”说一下:
实验室为了进行器件仿真(ise-tcad),其实主要就是进行数值解,购买了一台服务器,目的是希望一个屋(超过20人)所有有需求的人同时可以跑仿真,这个东西跑个一小时或一个星期甚至更长时间都说不定。
服务器是我还没进实验室的时候买的,8个CPU,每个是八核的,具体型号我已经忘记了,价钱大概在6k到7k之间,64G的内存,有四个网卡(这个确实有点多余)。由于我对这边的网络环境不是很熟,周围人更是没有这方面的意识,再加上软件需要破解(这个有点无奈),配置系统、远程登录(局域网内)等整个服务用了一个星期。
本来以为同样的一个工程文件在服务器上能够更快一些,结果却是和一般的机子没多在区别,惟一的好处是可以同时跑大概六七个工程文件(离预期差距太大)。
困境:
至今,在另一个局域网中的子机,通过windows自带的VPN服务,并不能多个同时访问服务器(不是网络入口,而是局域网内的一个子节点)。另一个问题是,能否加快单个工程文件的仿真速度(没听说这个软件能够并行运算)。
ps:如果以上术语有不恰当之处,请大家原谅。
 
2014-03-10

宋朝阳

发件人:lzt <lvzon...@gmail.com>
发送时间:2014-03-10 12:41
主题:Re: [XiDianLinux] Re: 生猛的计算机配置方案
收件人:"xidian_linux"<xidian...@googlegroups.com>
抄送:

lzt

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Mar 10, 2014, 11:06:24 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
首先4个网卡并不多余,如果是千兆的最好,这样上载数据会快很多,我说的那个微型集群的方案的一个优点也在于网络接口多,这样上载能力就很强了。

如果是USB2.0传输,最多也就是75M/s 如果是USB3.0 情况会好一些,但是4个千兆网卡绑定之后就有400M/s上载速度。

我们实验室的服务器是两张万兆网卡绑定,有2000M/s上载速度,图像数据通过多台计算机一起上传,磁盘阵列有800M/s前端带宽的控制板两个。

这样你上传10T的数据就不会很痛苦。

等一下,我有点儿事情,稍后回来接着写。



On Monday, March 10, 2014 10:08:47 PM UTC+8, young wrote:
既然谈到这个话题了,我把我们实验室面临的“困境”说一下:
实验室为了进行器件仿真(ise-tcad),其实主要就是进行数值解,购买了一台服务器,目的是希望一个屋(超过20人)所有有需求的人同时可以跑仿真,这个东西跑个一小时或一个星期甚至更长时间都说不定。
服务器是我还没进实验室的时候买的,8个CPU,每个是八核的,具体型号我已经忘记了,价钱大概在6k到7k之间,64G的内存,有四个网卡(这个确实有点多余)。由于我对这边的网络环境不是很熟,周围人更是没有这方面的意识,再加上软件需要破解(这个有点无奈),配置系统、远程登录(局域网内)等整个服务用了一个星期。
本来以为同样的一个工程文件在服务器上能够更快一些,结果却是和一般的机子没多在区别,惟一的好处是可以同时跑大概六七个工程文件(离预期差距太大)。
困境:
至今,在另一个局域网中的子机,通过windows自带的VPN服务,并不能多个同时访问服务器(不是网络入口,而是局域网内的一个子节点)。另一个问题是,能否加快单个工程文件的仿真速度(没听说这个软件能够并行运算)。
ps:如果以上术语有不恰当之处,请大家原谅。
 
2014-03-10

宋朝阳

发件人:lzt <lvzon...@gmail.com>
发送时间:2014-03-10 12:41
主题:Re: [XiDianLinux] Re: 生猛的计算机配置方案
收件人:"xidian_linux"<xidian_li...@googlegroups.com>

lzt

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Mar 10, 2014, 11:25:14 AM3/10/14
to xidian...@googlegroups.com
关于你们实验室网络结构,我通过你的语言描述尚且没法完全理解,你可以给我再详细讲一讲或是画一个图。

主要就是这句话我没理解“通过windows自带的VPN服务,并不能多个同时访问服务器

在我了解你们的网络结构之后我才能给出正确的意见。

这个服务器的最大特点是核多,而一般多核多cpu的时候,每个cpu的频率和计算能力并不怎么强大。

还有关于你们仿真用的工具,能不能给我详细的讲一下,我不知道什么是“进行数值解”   具体用的什么算法,哪一方面的,是动力方程还是优化模型,还是什么,这些都对应着不同的数值解工具。



On Monday, March 10, 2014 10:08:47 PM UTC+8, young wrote:
既然谈到这个话题了,我把我们实验室面临的“困境”说一下:
实验室为了进行器件仿真(ise-tcad),其实主要就是进行数值解,购买了一台服务器,目的是希望一个屋(超过20人)所有有需求的人同时可以跑仿真,这个东西跑个一小时或一个星期甚至更长时间都说不定。
服务器是我还没进实验室的时候买的,8个CPU,每个是八核的,具体型号我已经忘记了,价钱大概在6k到7k之间,64G的内存,有四个网卡(这个确实有点多余)。由于我对这边的网络环境不是很熟,周围人更是没有这方面的意识,再加上软件需要破解(这个有点无奈),配置系统、远程登录(局域网内)等整个服务用了一个星期。
本来以为同样的一个工程文件在服务器上能够更快一些,结果却是和一般的机子没多在区别,惟一的好处是可以同时跑大概六七个工程文件(离预期差距太大)。
困境:
至今,在另一个局域网中的子机,通过windows自带的VPN服务,并不能多个同时访问服务器(不是网络入口,而是局域网内的一个子节点)。另一个问题是,能否加快单个工程文件的仿真速度(没听说这个软件能够并行运算)。
ps:如果以上术语有不恰当之处,请大家原谅。
 
2014-03-10

宋朝阳

发件人:lzt <lvzon...@gmail.com>
发送时间:2014-03-10 12:41
主题:Re: [XiDianLinux] Re: 生猛的计算机配置方案
收件人:"xidian_linux"<xidian_li...@googlegroups.com>

乐园

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Mar 11, 2014, 6:45:51 AM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
我来说说器件仿真那些事。

首先,软件是商业软件,算法上是不能改的,也没这个实力改。这方面我懂的也不多,个人理解主要执行的是微分方程数值求解。

这个仿真可并行的地方很少,大部分一个实例只用一个CPU。对机器的性能要求是,高主频,足够的内存(看模型的复杂程度)。其次就是缓存了。

然后,机器最最重要的是稳定,异常的稳定。软件也要稳定。或许20天还是30天跑出来不是最重要的,但是,我希望如果预计30天能跑出来,它必须出来。不能到二十多天的时候突然崩溃,要重新来过。

目前我在“隔壁”实验室看到的情况是,用的是RHEL5系操作系统(没错。。2.6的内核),软件是早些时候的版本(2010 2011年左右)这些版本就已经够用,还经过了大量检验。

服务器都是整机买来的,不是自己配的,原因我猜很简单,仿真做的顺利一点,流片也好,实验也好,少失败一两次,钱就回来了。

服务器的多核主要体现在能运行多个仿真,核心数基本就和需要运行的仿真实例数匹配就行了。另外超线程技术这里不怎么适用,似乎实例数超过服务器CPU物理核心数,效能就下降很厉害了(没精确测试过)


所以,第一个问题:加快单个工程文件的仿真速度。用高主频的处理器,服务器不要过载。当然,最主要的,在不能并行化的情况下,合理选择参数,简化模型才是本质上减少计算量。

服务器访问的问题:我见过的方式都是VNC服务,通过VNC访问服务器。



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lzt

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Mar 11, 2014, 6:58:41 AM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
VNC好像只能连接一台服务器吧。我们实验室的计算机是通过ssh + 转发X 。

如果是windows可以用Xming + putty 这个非常生猛的。
收件人:"xidian_linux"<xidian_linux...@googlegroups.com>
抄送:
 
可以理解成云计算的物理结构,或是具体实现?

云计算好像任务不能横跨多个物理cpu。所以,这个应该比云计算难度更大一些。

其实,我也不是很懂云计算,就是看过广告,还是视频广告那种。-_-|||

On Monday, March 10, 2014 12:36:32 PM UTC+8, Wisatbff Li wrote:
看起来好像云计算。。(不懂

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宋朝阳

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Mar 11, 2014, 9:02:43 AM3/11/14
to xidian_linux
实验室除了服务器是centos,其余的都是window系统,台式机A0开启windows的Routing and Remote Access服务,设置启动类型为自动,并启动服务;台式机B0建立vpn连接就行,配置的细节就不详细说了。希望B实验室的任何一台机子都能够访问A实验室中的服务器。但是目前的情况是B中同时只有一台机子能够访问A中的服务器。吐槽一下,windows的那个服务往往自动关闭,所以连接偶尔甚至连不上。
关于器件仿真的问题,前面那个同学@乐园说的很详细了,我猜他应该就在我们A实验室的附近。主要进行的就是二阶偏微分方程,利用牛顿行等数值迭代算法。器件上需要画网格,每个网格都要进行一次计算,格点非常多。
A中实验室的任何一台机子均可以通过VNC server来访问服务器,而B中的机子先连接上A0(只能有一个)然后才通过VNC server来访问服务器。
 
 
2014-03-11

宋朝阳

发件人:lzt <lvzon...@gmail.com>
发送时间:2014-03-10 23:25
主题:Re: Re: [XiDianLinux] Re: 生猛的计算机配置方案
收件人:"xidian_linux"<xidian...@googlegroups.com>
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乐园

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Mar 11, 2014, 9:25:46 AM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
啊 那同时访问多台服务器是什么意思。。

宋朝阳

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Mar 11, 2014, 9:42:49 AM3/11/14
to xidian_linux
没有“同时访问多台服务器”,是“B中的多台台式机访问一个服务器”,图中A中只有一个服务器。
 
2014-03-11

宋朝阳

发件人:乐园 <xu9...@gmail.com>
发送时间:2014-03-11 21:25
主题:Re: [XiDianLinux] 回复: 生猛的计算机配置方案

Steve Xia

unread,
Mar 11, 2014, 11:22:34 AM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
查了下资料,发点链接给大家参考下
专业级显卡和图形显卡的区别:http://notebook.it168.com/a2010/0609/1064/000001064432_all.shtml
为什么工作站比普通PC贵那么多?http://www.zhihu.com/question/21611369
如何将手中 20 多台旧电脑,组建一台超级计算机?http://www.zhihu.com/question/21116669

Steve Xia

unread,
Mar 11, 2014, 11:36:35 AM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
公司的一个编译服务器CPU E5-2609*2 (四核四线程 双CPU),实测编译速度不如我的笔记本虚拟机快(i7-3630QM + 4G*2 + SSD 256GB,同样代码8线程全部编译在服务器上花费3分30s以上,在笔记本虚拟机上大约3分10s 。我分析了一下原因可能差别在于:磁盘速度SSD远超机械硬盘;E5-2609没有超线程级数,频率固定为2.4GHz,而I7-3630QM睿频可达3.4GHz。就编译C项目而言CPU频率和磁盘IO的影响还是相当大的。计算集群是个有意思的东西,不过要解决的问题也是相当的多,而且适用范围比较小,一些特别设计的并行运算软件才可以比较好的发挥系统性能。

ggarlic

unread,
Mar 11, 2014, 11:21:59 PM3/11/14
to xidian...@googlegroups.com
有没有启用-j 啊,给我们看看你的主要编译参数呗
> --
> 您收到此邮件是因为您订阅了“西电开源社区”邮件列表。
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Welcome to World of Ggarlic
http://ggarlic.org

Steve Xia

unread,
Mar 12, 2014, 12:11:15 AM3/12/14
to xidian...@googlegroups.com
都是make clean; make -j8


On Wednesday, March 12, 2014 11:21:59 AM UTC+8, ggarlic wrote:
有没有启用-j 啊,给我们看看你的主要编译参数呗

2014-03-11 23:36 GMT+08:00 Steve Xia <xiat...@gmail.com>:
> 公司的一个编译服务器CPU E5-2609*2 (四核四线程 双CPU),实测编译速度不如我的笔记本虚拟机快(i7-3630QM + 4G*2 +
> SSD 256GB,同样代码8线程全部编译在服务器上花费3分30s以上,在笔记本虚拟机上大约3分10s
> 。我分析了一下原因可能差别在于:磁盘速度SSD远超机械硬盘;E5-2609没有超线程级数,频率固定为2.4GHz,而I7-3630QM睿频可达3.4GHz。就编译C项目而言CPU频率和磁盘IO的影响还是相当大的。计算集群是个有意思的东西,不过要解决的问题也是相当的多,而且适用范围比较小,一些特别设计的并行运算软件才可以比较好的发挥系统性能。
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lzt

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Mar 12, 2014, 3:22:23 AM3/12/14
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推荐一本书关于并行计算的数 非常流行

https://www.kernel.org/pub/linux/kernel/people/paulmck/perfbook/perfbook.html

刚才在solidot上看到的。

ggarlic

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Mar 12, 2014, 4:51:30 AM3/12/14
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好著名的书
其实我没看懂solidot那篇文章的意思,这个页面一直都在啊,而且也还是rc啊,我是rc6的时候下载的
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Pengfei Hao

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Mar 27, 2014, 9:21:18 PM3/27/14
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呵呵, 什么样的机器都见过了,都是浮云.


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