depende das chamadas ajax que vc tem feito com o jquery para ter uma solução, se postar um trecho seria mais fácil ajudar.
não existe só o problema das ;
JS no internet explorer tb da problema com sobra de vírgulas em declarações de objetos literais, tipo:
$.ajax( { cache: false, url: '/', });
uma vírgula no final e ta lá um erro que só vai acontecer no IE. Não só é bom ficar atento também a esse problema como isso é um sinal de Ctrl C + Ctrl V no código, evite.
O lance do cache também é muito importante pra chamadas ajax no IE, tem n formas de desabilitar o cache, se utilizar o $.ajax já tem a resposta no exemplo ali em cima, as outras vc consegue achar pelo google, já sabe o que procurar.