GAE のサーバーには通常シェルでのログインはできなかったと思いますので、ファイルの場所を知ることに意味はないと思うのですが、意味を取り違えていたらすみません。(Managed VM なら SSH ログインして使うことができますが…。)
一応 GAE で Python のシェル インターフェースを動かすという手法はあるようですが、多分これはお探しの回答ではないでしょう。
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