PARTÍCULA DE RECONOCIMIENTO DE LA SEÑAL (SRP) EN ARCHEA

[Any Laura Flores]

PARTÍCULA DE RECONOCIMIENTO DE LA SEÑAL (SRP) EN ARCHEA.
Laura Flores Villegas1
1 Facultad de Medicina, UNAM, Departamento de Microbiología y
Parasitología, Lab. Biología de Parásitos.

En células animales, la SRP incluye una molécula de RNA (/S RNA) y
seis proteínas nombradas de acuerdo a su peso molecular: SRP72, SRP68,
SRP54, SRP19, SRP14 y SRP. SRP54 y un bucle de inicio, hélice 8 del
7SRNA. Están conservados en Archea y Eubacteria, y junto con una
segunda región hélice de RNA (hélice 6) constituyen el dominio de
unión del péptido señal (dominio S) del SRP (Doudna y Batey, 2004).
La clasificación de proteínas fundamentalmente mantiene la identidad y
función de cada célula, con la participación de la partícula de
reconocimiento de la señal (SRP). Excepto en los cloroplastos, la SRP
es una ribonucleoproteína. La SRP RNA es comúnmente compuesta de
alrededor de 300 residuos de nucleótidos y forma un complejo con una
proteína extraordinariamente conservada: SRP54 en Archea y Eucaria ó
Ffh (por sus siglas en inglés: Fifty-four homolog) en bacterias.
Una proteína de 19 kDa, SRP19, está presente en Archea y Eucaria, pero
ausente en las bacterias. Los polipéptidos que son homólogos para
Eucaria son los heterodímeros: SRP9/14 y SRP 68/72, y no han sido
encontrados en el genoma de Archea.
Las estructuras secundarias del SRP RNA de Archea poseen regiones
extensas de bases pareadas, las cuales forman una hélice central
prominente flanqueada por un dominio pequeño (Alu) y un dominio largo
(S). Así, se asemeja a la estructura secundaria de los SRP RNAs de
mamíferos. Se les ha asignado número a las hélices del 1 al 8, y la
sección helical es designada con las letras a-f (Fig. 1).
Los SRP RNAS de la mayoría de las Archeas (Tabla 1), así como en
ciertas bacterias (por ejemplo: Bacilli y Clostridia) emparejan sus
regiones terminales para formar una hélice 1. La Hélice 7 ha sido
encontrada sólo en SRP RNAs de Eucaria, donde es más prominente en
algunos hongos y protozoarios (Zwieb y Bhuiyan, 2010).






Fig. 1 Estructura secundaria del SRP RNA en Archaeoglobulus fulgidus.
Tabla 1. Tipos de SRP y secuencia de aminoácidos* en diferentes
especies de Archea.*Secuencias tomadas de: http://rnp.uthscsa.edu/rnp/SRPDB/srpprotein.html.
Subdominio Especies Componentes Secuencia de aminoácidos
Crenarchaeota Aeropyrum pernix SRP19
SRP54 1 mvflrekegp sggsgrriil wpayfdstlp rrlgrrvprd mgvpspkped
vaeaarragf
61 eavveessyp rlwwrvrrri vvlapedvsk tdiikavate lrkiaaarrk rs

Sulfolobus solfactaricus SRP54 con hélice 8
SRP54 dímero
SRP54 con péptido señal
SRP19 con hélice 6 y 8 1 mslrdlkeen riviwpsyff sptrskgrrl aripykikte
elvstlrelg ldpivienkk
61 yprdrkinfl iavkkvkskn ytlkiihnal mgtrqtnpnk sn




Euryarchaeota Archaeoglobulus fulgidus SRP19
SRP54M 1 mkecvvwtvn ldskksraeg rriprrfavp nvklhelvea ckelglkfra
eekkypksww
61 eeggrvvvek rgtktklmie larkiaeire qkreqkkdkk kkkk

Pyrococcus furiosus SRP19
SRP54
FtsY 1 mgrfvvwpse ldsrlsrkyg rivprsiave sprveeivra aeelkfkvir
veedklnprl
61 sgideelrtf gmivlespyg kskslkliaq kirefrrrsa


REFERENCIAS.
• Zwieb, Christian y Bhuiyan Shakhawat.2010. Archaea signal
Recognition Particle Shows the way. Archaea. Jun 28:1-11.
• Doudna Jennifer A. y Robert T. Batey. 2004. Structural Insights into
the signal Recognition particle. Annu. Rev. Biochem. 73:539-57.
• http://rnp.uthscsa.edu/rnp/SRPDB/srpprotein.html