Hiệp định AJCEP là văn kiện pháp lý quan trọng, xác lập mối quan hệ hợp tác kinh tế chặt chẽ, toàn diện giữa ASEAN-Nhật Bản trong thời gian tới.. Đến nay, Nhật Bản là đối tác thương mại lớn thứ ba của ASEAN với kim ngạch gần 200 tỷ USD và là đối tác đầu tư trực tiếp lớn nhất trong khu vực ASEAN với giá trị đầu tư hàng năm đạt trên 10 tỷ USD.

Đối với quan hệ song phương Việt Nam-Nhật Bản, việc ký kết Hiệp định AJCEP cũng thể hiện thiện chí hợp tác của Chính phủ Việt Nam và Nhật Bản nhằm xây dựng quan hệ đối tác chiến lược vì hòa bình và thịnh vượng ở khu vực Đông Á

Trong bối cảnh mối quan hệ hợp tác hữu nghị giữa hai nước đang bước sang giai đoạn phát triển mới, Hiệp định AJCEP và Hiệp định đối tác kinh tế Việt Nam-Nhật Bản (EPA Việt Nam-Nhật Bản) hiện đang được đàm phán sẽ góp phần phát huy tối đa tiềm năng, lợi thế của mỗi bên, nâng cao hiệu quả hợp tác kinh tế giữa hai nước, đáp ứng xu thế chung về hội nhập kinh tế của khu vực và thế giới.