No puedo pensar en ninguna area donde Windows es mejor que linux en terminos de servidores de web y correo.
Un servidor de Linux necesita menos memoria RAM, disco duro y poder de procesamiento que un servidor Windows, entonces cuesta menos en hardware. Puedes administrar Linux facilmente desde la linea de comando, entonces
su servidor no necesita un entorno grafico, que reduce mucho el costo
del servidor y no necesitas una conexión rapida de internet para administrarlo desde tu casa. Tambien, Linux es mas seguro entonces hay menos problemas de virus, software de espia, etc. Hay nucleos de linux afinados para servidores web y correo. El rendimiento de Apache es mucho mejor bajo Linux que Windows. Además, el rendamiento de Samba en Linux es mejor que SMB en Windows (si tienes un servidor de archivos). Es molestoso y costoso tratar con las licencias de Windows, IIS, etc.
--Amos