Solução:
1 - Bootar a máquina com a mídia de instalação do windows;
2 - Entrar no console de recuperação;
3 - Abrir o notepad;
5 - Se for o caso, renomear o arquivo ntfs.sys para ntfs.sys_old;
6 - Navegar até a pasta %windir%\winsxs e localizar um arquivo Ntfs.sys em uma vesão mais antiga. No meu caso era: 6.1.7601.17945;
7 - Copie o arquivo mais antigo para a pasta %windir%\system32\drivers.
8 - Reboote o sistema.
Tem um amigo que acabou de dizer que atualizou o windows dele e reiniciou várias vezes e não deu pau. Acho que o problema já foi corrigido.