Dúvida instalação OpenFOAM (Paraview)

[vitormh...@gmail.com]

Bom dia!

Olá a todos, primeiramente gostaria de me desculpar, sei que esse
assunto já foi abordado aqui diversas veses, mas mesmo procurando em
outras respostas não consegui sanar minhas duvidas.

Eu sou usuário novo no linux, utilizava o FLUENT como ferramenta de
CFD agora estou migrando para o OpenFOAM.

Estou usando UBUNTU 8.10 64 Bits, diz download de todos arquivos do
OpenFOAM 1.5, e descompactei eles na minha pasta (/home/vitor/OpenFOAM/
OpenFOAM-1.5 e /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty), até ai tranquilo...

Editei meu arquivo ".bashrc" com a linha ". $HOME/OpenFOAM/
OpenFOAM-1.5/etc/bashrc" e dps chamei este arquivo na shell....

depois fiz o teste da instalação obtendo o erro:

Test_rsh: Unsuccessful_connection_refused*
yes
Test_ssh: Unsuccessful_connection_refused*
yes

mas pelo que eu li isso é normal (é mesmo?)

rodo uma simulação de exemplo

digito: " cd $HOME/OpenFOAM/$USER-$WM_PROJECT_VERSION/run/tutorials/
icoFoam/cavity "
e depois " blockMesh" e "icoFoam"...

tudo certinho, então o OpenFOAM está isntalado...

Ai tento isntalar o ParaView da seguinte maneira:

" * cd $FOAM_INST_DIR/ThirdParty
* rm -rf ParaView3.3-cvs/platforms
* buildParaView3.3-cvs"

e retorna um erro:

"Building ParaView3.3-cvs
MPI support : OFF
Python support : OFF
MESA support : OFF
Source : /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs
Target : /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/
platforms/linux64Gcc
/home/vitor/OpenFOAM/OpenFOAM-1.5/bin/buildParaView3.3-cvs: 64: cmake:
not found
make: *** Nenhum alvo indicado e nenhum arquivo make encontrado.
Pare.
done"

Primeiro chequei a verção do "qmake" (qmake-version) e ele não
instava instalado, instalei as bibliotécas "libmpfr-dev" e "libqt4-
dev", e um pach "vtkOpenFOAMReader-
scriptedPreInstall-20080728.tar.bz2"...
Quando dou um qmake-version ele retorna
"vitor@vitor-laptop:~/OpenFOAM/ThirdParty$ qmake --version
QMake version 2.01a
Using Qt version 4.4.3 in /usr/lib"

No site do OpenFoam, ele fala que tem q ser um qt 4.3.X mas não acho
em nenhum lugar para instalar...
e acho que já modifiquei tanto nesse "qmake" ou "qt" que posso ter
feito besteira...
tem como voltar ao estado original?


Obrigado a todos, e novamente desculpem pelo tópico "repetido"...

[Luiz F.]

Oi, Vitor.

Cara, leia a mensagem de erro que da compilação. Vou colocá-la aqui em
baixo novamente.

/home/vitor/OpenFOAM/OpenFOAM-1.5/bin/buildParaView3.3-cvs: 64: cmake:
not found
make: *** Nenhum alvo indicado e nenhum arquivo make encontrado.
Pare.
done"

A primeira linha desta seleção do erro que coloquei aí em cima está te
dando a dica. Cmake não foi encontrado.

Para esclarecer melhor, o cmake é um programa que o OpenFOAM usa para
compilar o paraview/paraFOAM. Procure e instale o cmake no seu
sistema.

Quanto à versão do qt, realmente o pessoal que desenvolve o paraview
pisou na bola. Mas existe um meio de enganar a compilação do paraview
e ele aceitar uma outra versão do qt. Para mais detalhes, veja o link
abaixo.

http://www.albertopassalacqua.com/?s=zypper


Se surgirem mais dúvidas, é só perguntar.

Abraço,
Luiz F.

[vitor henrique]

Olá Luiz,

Primeiramente muito obrigado pela ajuda...

fui no gerenciador de pacotes Synapctic e instalei o cmake...

tentei compilar o paraview novamente e obtive o erro:

"Building ParaView3.3-cvs
    MPI support    : OFF
    Python support : OFF
    MESA support   : OFF
    Source         : /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs
    Target         : /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/platforms/linux64Gcc

CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!!
CMake has most likely not been installed correctly.
Modules directory not found in
/home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/cmake-2.4.6/platforms/linux64/bin
CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting.

make: *** Nenhum alvo indicado e nenhum arquivo make encontrado.  Pare.
done"

Lendo, parece q o cmake foi instalado incorretamente, acho que já mudei tanto nos pacotes que fiz besteira...
vou formatar meu linux hoje a noite e começar do zero...
vou instalar somente o cmake (pode ser pelo gerenciador?)

Ele fala pra instalar "qt4-devel" mas o gerenciador não acha esse pacote,  ele acha apenas "libqt4-devel" ...
e ele tb pede para digitar "zypper" como administrador nessa biblioteca... o que isso significa?


Muito obrigado novamente.


Atenciosamente

Vitor Henrique

[Luiz F.]

Fala Vitor,

Hum... Calma, calma.... Leia novamente o erro que está dando......
Vamos lá!

Modules directory not found in
/home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/cmake-2.4.6/platforms/linux64/bin
CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting.

O OpenFOAM procura o cmake no diretório ThirdyParty do OpenFOAM... E
vc instalou o cmake do sistema, que fica em outro diretório. Vamos
tentar consertar isso. Abra o seguinte arquivo:

~/OpenFOAM/OpenFOAM-1.5/etc/apps/paraview3

E veja logo nas primeiras linhas do script:

export CMAKE_HOME=$WM_THIRD_PARTY_DIR/cmake-2.4.6/platforms/$WM_ARCH

if [ -r $CMAKE_HOME ]; then
export PATH=$CMAKE_HOME/bin:$PATH
else
unset CMAKE_HOME
fi

No OpenSuse, o cmake do sistema fica em /usr/bin. Portanto, mude a
primeira linha para algo como:

export CMAKE_HOME=/usr

Tem que ver exatamente o local onde o cmake está instalado no Ubuntu e
mudar de acordo. Note que essa dica é um cambalacho sinistro e não sei
se iria funcionar perfeitamente. Tem que ver. Uma pergunta: dentro do
diretório ThirdyParty não tem nenhum cmake não, né?

A diferença dos nomes das bibliotecas do qt aparecem devido a
distribuição do Linux. O nome 'qt4-devel' é o pacote do OpenSuse, que
usa o programa 'zypper' para instalar programas no sistema. Já o
Ubuntu, usa o 'synaptic' (e o 'dpkg') para gerenciar os programas e o
nome dos programas e bibliotecas são diferentes dos do OpenSuse. Ou
seja, nomes diferentes para a mesma coisa. No seu caso, 'libqt4-devel'
é a opção correta mesmo. Veja que os desenvolvedores comentam isso na
linha 52 do arquivo README na raiz do OpenFOAM.

Antes eu usava o Ubuntu, mas como o OpenFOAM foi todo implementado no
OpenSuse, passei a usar essa última distribuição. Fiz isso
principalmente porque a maioria das dicas eram direcionadas para o
OpenSuse e eu tinha que ficar brigando no Ubuntu para fazer tudo
funcionar como devia. Contudo, devido a popularidade do Ubuntu, os
desenvolvedores do OpenFOAM estão adaptando aos poucos o código e sua
compilação ao Ubuntu. Mas mesmo assim, eu ainda acho que as coisas
funcionam muito melhor no OpenSuse. Se for o caso de vc re-instalar o
seu sistema e tiver a cabeça aberta para experimentar uma outra
distribuição, fica aí a dica.

Um abraço,
Luiz F.

[vitor henrique]

Olá Luiz,

Bem, o mais estranho de tudo, é que dentro da pasta "ThirdParty" tem uma pasta do "cmake-2.4.6" que vem junto com todo o pacote que é baixado no site do OpenFOAM.

pra mim, como já mencionei, a única dificuldade de instalar o OpenSuse é que sou usuário novo no linux, e a "interface gráfica" do ubuntu é extremamente amigável...

mas, acho que vou aceitar sua dica e ja estou baichando o OpenSuse aqui...
Existe muita incompatibilidade entre a verção do QT e o OpenSuse 11? é melhor baxar uma verção mais antiga do OpenSUSE?

Abraço, espero sua resposta para formatar meu linux! =)
outra pergunta, qual ambiente gráfico que o OpenSUSE usa? KDE, GNOME? outro?

[vitor henrique]

Mais uma dúvida... decidi instalar o OpenSUSE mesmo...

no tutorial que vc mencionou ele faz a instalação do OpenFOAM pelo repositório "git", isso requer compilar todo OpenFOAM, posso instalar ele da maneira que eu acho fácil (pegando os aruqivos zipados e descompactando)? ou vc acha que da menos problema compilar todo código fonte?

o que vc sugere?

Abração, e espero não ter que encomodar denovo1 ;)

Vitor Henrique

[Luiz F.]

Oi Vitor,

Então, vais para o OpenSuse?? Ok, sem problema. Como dica para os
novos usuários de Linux, ontem mesmo o Mitre (também autor do Notas em
CFD) e eu liberamos uma apostila (que acabou virando um livro -
completamente gratuito) sobre Linux. O Mitre fez a maior parte da
apostila e ele preferiu usar a interface do Ubuntu para exemplos na
apostila. Vale a pena a leitura e vc pode ver o anúncio oficial (e os
links para baixar) no site abaixo:

http://jfmitre.com/

Quanto a instalação do OpenFOAM: Desculpe, mas de que tutorial vc está
falando? Assim como no Ubuntu, o OpenFOAM é instalado da mesma forma
no OpenSuse. Não tem diferença nenhuma.

O lance é que para quem quer desenvolver dentro do OpenFOAM, o ideal é
ter uma das versões de desenvolvimento baixadas pelo git (versão da
OpenCFD) ou pelo svn (versão da Wikki). Eu uso essa última.

Mas pelo que eu entendi, vc está começando a aprender o OpenFOAM.
Esqueça as versões de desenvolvimento e use aquela que vc pode baixar
no site da OpenCFD. Depois de aprender a versão "normal", e se quiser
mais informações sobre desenvolvimento no OpenFOAM, é só perguntar.

Um abraço,
Luiz F.

[vitor henrique]

Olá luiz!

Nossa, pra falar verdade estou migrando para o OpenFOAM justamente pela possibilidade de modificar o códico fonte (programo em C++)
Foda é que compilar o código todo deve demorar um bucado =/
Qual a diferença entre essas verções que vc me citou? (git ou svn)

Vou seguir este tutorial: http://www.albertopassalacqua.com/?s=zypper


Abraços novamente!

Vitor Henrique

[Luiz F.]

Oi Vitor,

Então vamos ter no futuro mais um desenvolvedor do OpenFOAM. Boa
pedida.

Para desenvolvimento de códigos próprios, ou seja, novos solvers ou
utilitários, tanto faz usar a versão fornecida pelo site da OpenCFD ou
as versões do svn ou git. Em ambas vc tem a possibilidade de criar
seus códigos. Como você está iniciando o uso tanto em Linux quanto no
OpenFOAM, eu até sugiro que se comece pela versão do site. Quando se
sentir mais confiante e com mais traquejo em Linux, migre para uma
versão de desenvolvimento.

Porque tem as versões de desenvolvimento?
- Bugs são possíveis em qualquer código, seja ele livre ou não. Quando
se descobre um bug, ele pode ser corrigido e imediatamente incorporado
à versão de desenvolvimento. Na versão do site, as correções serão
incorporadas apenas na próxima versão do OpenFOAM.
- Contribuições de terceiros podem ser anexadas ao OpenFOAM a qualquer
momento. Ou seja, novos solvers, utilitários, novas funcionalidades,
etc. podem ser adicionados a qualquer momento na versão de
desenvolvimento.

Existem outras vantagens em usar as versões de desenvolvimento, mas
para mim, as principais são as que coloquei acima. Contudo, acredito
que o usuário tenha que ter uma conhecimento mais profundo tanto do
sistema quanto do funcionamento do OpenFOAM para usar essas versões.
Imagine vc, ainda aprendendo a usar e programar no OpenFOAM e tendo
que compilar tudo (!) do zero, tendo que verificar alguns erros de
compilação (possíveis de acontecer) quando atualiza o OpenFOAM para a
versão mais nova? Eu não vejo isso como vantagem, até que vc tenha
conhecimento suficiente para poder lidar com isso. Aprenda a compilar
seus próprios solvers, depois compile o OpenFOAM por inteiro. Um passo
de cada vez.

Mas isso é uma escolha pessoal. Você pode querer começar o seu
aprendizado pela compilação, sei lá... Existem vários recursos que
podem ser usados para auxiliar e acomodar o OpenFOAM ao sistema. Entre
essas funcionalidades, compilação de códigos em paralelo, usar o
compilador do próprio sistema, bibliotecas diferentes da padrão, etc.

Ah, sim. As diferenças entre as versões git e svn.

A versão git é desenvolvida e atualizada pela OpenCFD, mantenedora
oficial do OpenFOAM. Já a versão fornecida pelo svn é mantida pelo
Prof. Hrvoje Jasak (Wikki). Eu uso essa última e tenho vários motivos
para tal, entre eles:
- Atualização muito rápida. Qualquer erro (e são muito poucos) são
corrigidos e atualizados quase que imediatamente.
- Por filosofia, o Prof. Jasak é muito mais aberto à incorporar
contribuições de terceiros. Com isso, possui muito mais solvers e
utilitários.
- Funcionalidades exclusivas, implementadas pela comunidade do
OpenFOAM.
- O Hrvoje faz questão de manter sua versão de desenvolvimento em
harmonia com a da OpenCFD. Nota: houve uma grande mudança na estrutura
do OpenFOAM-1.4.1 para a 1.5. O Jasak adaptou tudo para ficar de
acordo com o padrão escolhido pela OpenCFD.
- Quando o Hrvoje veio para o Brasil para a minha banca de defesa de
doutorado, levei ele e a esposa ao bar Devassa na Barra da Tijuca. Pô,
o cara fez questão de pagar a minha cerveja!! Não tem como, uso a
versão dele...

Brincadeiras à parte, na minha opinião, a OpenCFD é um pouco fechada
em relação a receber e incorporar as contribuições da comunidade do
OpenFOAM. E eu, por filosofia, não gosto disso.

Para quem quer tentar compilar a versão OpenFOAM dev do svn, deve ter
instalado em seu computador os seguintes pacotes:
subversion
binutils
mpfr
gmp
flex++

Para maiores referências, leia as mensagens no Fórum do OpenFOAM:
http://www.cfd-online.com/Forums/openfoam-installation/63866-installation-of1-5-dev.html

Para baixar a versão dev, vá ao diretório ~/OpenFOAM e dê o comando:

svn checkout http://openfoam-extend.svn.sourceforge.net/svnroot/openfoam-extend/trunk/Core/OpenFOAM-1.5-dev/
OpenFOAM-1.5-dev/

A última versão do código fonte do OpenFOAM-1.5-dev será baixado em
seu computador. Para compilação, vá ao diretório OpenFOAM-1.5-dev e
execute:

./Allwmake

Note que TUDO será compilado e isso pode ser um pouco demorado
dependendo da configuração da sua máquina.

Puxa, reli o texto e acabou ficando legal... Vai para o Notas em CFD!!

Um abraço,
Luiz F.

[vitor henrique]

Olá Luiz, tudo bem??

bem, migrei para o openSUSE, fiz e finalmente instalei o openfoam e o paraview com a seguinte mensagem:

    Installation complete
    Set environment variables:
    - ParaView_INST_DIR to /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs
    - ParaView_DIR to /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/platforms/linux64Gcc
    - PV_PLUGIN_PATH to /home/vitor/OpenFOAM/OpenFOAM-1.5/lib/linux64GccDPOpt
    Add /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/platforms/linux64Gcc/bin to PATH

instalei o PV3FoamReader com alguns "warnings", ai tentei rodar um caso de teste, rodando os seguintes comandos:

  cd $HOME/OpenFOAM/${USER}-${WM_PROJECT_VERSION}/run/tutorials/icoFoam/cavity
  blockMesh
  icoFoam
  paraFoam

PS: Já rodei o test da isntalação do openFOAM e está tudo certinho =)

Só que na hora de rodar o paraFoam ele abre e fecha o paraview e fica o seguinte erro no terminal:

vitor@linux-u232:~/OpenFOAM/vitor-1.5/run/tutorials/icoFoam/cavity> paraFoam
ERROR: In /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/VTK/Rendering/vtkXOpenGLRenderWindow.cxx, line 398
vtkXOpenGLRenderWindow (0x12520a0): Could not find a decent visual



ERROR: In /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/VTK/Rendering/vtkXOpenGLRenderWindow.cxx, line 398
vtkXOpenGLRenderWindow (0x12520a0): Could not find a decent visual



X Error: BadValue (integer parameter out of range for operation) 2
  Extension:    129 (Uknown extension)
  Minor opcode: 3 (Unknown request)
  Resource id:  0x21
ERROR: In /home/vitor/OpenFOAM/ThirdParty/ParaView3.3-cvs/VTK/Rendering/vtkXOpenGLRenderWindow.cxx, line 623
vtkXOpenGLRenderWindow (0x12520a0): Cannot create GLX context.  Aborting.


/home/vitor/OpenFOAM/OpenFOAM-1.5/bin/paraFoam: line 83:  5220 Abortado                paraview --data=$caseFile
vitor@linux-u232:~/OpenFOAM/vitor-1.5/run/tutorials/icoFoam/cavity>

Tem idéia de como me ajudar agora? hehe, (to quaseeeeeeee lá!!!!)

[Luiz F.]

Oi Vitor,

Ih, qual a sua placa de vídeo? Talvez possa ser apenas uma
configuração do driver de vídeo. Coloque aqui o resultado do comando:

/sbin/lspci

Se for uma placa Nvidia, talvez seja necessário instalar o driver
proprietário da Nvidia para ficar ok. Vamos ver. Eu ainda não tinha
esbarrado nesse tipo de erro...

Abraço,
Luiz F.

[vitor henrique]

Minha placa de video é uma GeForce  8400M GS tenho instalado o drive proprietário mais recente da NVIDIA, dei uma boa fuçada nas configurações até alterei algumas coisas..

já tentei editar este arquivo "/etc/X11/xorg.conf"' conforme descrito neste tutorial:http://www.cfd-online.com/OpenFOAM_Discus/messages/1/4438.html

e tb tentei comentar estas linhas como descrito neste tutorial: http://public.kitware.com/pipermail/vtkusers/2006-August/086674.html

e nada =/

muito estranho o erro, parece que da erro na hora de renderizar usando o GLX, procurei algum outro drive para minha placa mas simplismente não encontrei (vou continuar procurando)..

Obrigado

[Luiz F.]

Vc checou esse post?

http://www.cfd-online.com/Forums/openfoam-paraview/61051-problem-paraview-parafoam.html

além disso, funciona se vc converte os resultados para VTK e
visualiza?

foamToVTK -case <nome_do_caso>

Daí é só abrir o paraFoam e selecionar o arquivo VTK. Funciona assim?

LF

[vitor henrique]

o problema é que nem o "paraview" abre... mesmo tentando iniciar ele sem nem ao menos ligação com o openfoam...

Quando eu vou no terminal e digito "paraview" ele já retorna o mesmo erro... =/

vi no site do paraview que tem uam versão 3.4 para download, será que eu posso baixar essa verção e compilar? ou a versão que vem no opemFOAM é modificada para o mesmo??

desde já agradeço!


Vitor Henrique

[vitor henrique]

Olá a todos, depois de muitooo tempo eu volto a este tópico, 

Eu consegui sanar este erro na época, e infelizmente não postei aqui como, achei melhor voltar e deixar escrito para caso alguma pessoa mais encontre existe uma referência.

Depois de muito procurar descobri que o erro na verdade era no drive da placa de video, que no meu caso é uma nvidia 8400, parece que os drives da familia 175 - 180 estavam com esse bug, testei drives mais velhos e mais novos depois com sucesso, paraview/parafoam funcionam perfeitamente!

Desculpem a demora, mas creio que antes tarde do que nunca!! hehe..

Sds,

Vitor Henrique

Ps: atualmente estou com um novo probleminha compilando o paraview, já abri um novo tópico, se alguém puder ajudar:

http://groups.google.com.br/group/cfdbrasil/browse_thread/thread/5b77aa2efa218af9?hl=pt-BR